Экспозиция основного зала, насчитывающая свыше полутора тысяч экспонатов, среди которых немало уникальных реликвий, знакомит посетителей с историей одного из старейших университетов России.
Открывает её документ особой исторической значимости - Утвердительная Грамота Казанского императорского Университета, подписанная Александром I 5 ноября 1804 года и скрепленная подписью министра народного просвещения П.В.Завадовского.
Интересна и сама история существования этого документа. В феврале 1805 года, через два месяца после подписания, Утвердительную Грамоту доставил в Казань первый попечитель Казанского учебного округа С.Я.Румовский и вручил ее Совету университета. В 1806 году был изготовлен специальный ковчег из красного дерева, украшенный резьбой и бронзой, в котором она хранилась более 100 лет.
После 1917 года Грамота была изъята из университета - советская власть считала недопустимым нахождение в советском вузе документа, содержащего царскую символику в тексте и оформлении. В 1933 году по постановлению ОГПУ она была передана в Центральный краеведческий музей ТАССР (ныне Национальный Музей Республики Татарстан).
К открытию университетского музея художник В.Дайчман изготовил муляж футляра и первой страницы Грамоты. И все же отсутствие оригинала не давало покоя сотрудникам музея. По их инициативе Совет КГУ просил вернуть пожалованную университету Грамоту её законному владельцу. В марте 1993 года она заняла достойное место в экспозиции музея.