Музей исламской культуры поделен на 3 сектора:
1. Мусульманская цивилизации Поволжья: от Булгара до Казани.
2. Ислам от эпохи реформаторства до современности (вторая половина XVIII — начало XXI вв.)
3. Книжная культура татарского народа.
Обновленная экспозиция сделана с интерактивными элементами:
«Листающийся Коран» — центральный экспонат Музея — демонстрирует «Казанское издание» Корана, знаменитое тем, что опубликованный в 1803 году в Казани арабский текст Корана был первым изданием, осуществленным самими мусульманами.
• Инсталляция «Казанский Кремль в XV-XXI вв.» (реконструкция архитектурного облика «Казанского Кремля» в формате 3D).
• «Интерактивное окно в «Кабинете просветителя» с видами старой Казани.
• Проекция «Урок в медресе» (шакирды учат азан – призыв к молитве).
• Компьютерная инсталляция «Поющий шамаиль».
• 11 планшетов, дополняющих предметный ряд тематических блоков экспозиции.