Идея создания музея родилась в 1970-е годы во время подготовки к 100-летнему юбилею КГПИ (Казанский государственный педагогический институт, позже Татарский государственный гуманитарно-педагогический университет, с 2011-ого года в составе Казанского федерального университета).
Однако в 1980-е годы музей закрыли из-за нехватки учебных помещений для студентов. Коллекции перенесли в подвал, из-за чего в дальнейшем многие материалы были утрачены.
Новая глава в истории музея началась в 2003 году, когда ректор КГПУ З. Г. Нигматов решил его воссоздать. Для этого выделили помещение в здании КГПИ, разработали научную концепцию и приступили к оформлению экспозиции.
Здесь представлены следующие темы: «Начало пути», Казанский учительский институт (1876–1918), Казанский педагогический институт (1918–1919), Восточно-педагогический институт (1920-е), Татарский педагогический институт(1931–1934), КГПИ (1934–1994), в составе КФУ. Также есть разделы, посвященные годам Великой Отечественной войны, ректорам вуза и выдающимся выпускникам. Отражена в экспозиции современная деятельность Института психологии и образования КФУ.