Музей истории в Йошкар-Оле работает с осени 1996 года, создан по инициативе городской администрации. Пополняемая экспозиция размещается в двухэтажном краснокирпичном доме.
Постоянная выставка в музее посвящена судьбе города в XVI–XX веках, включает свыше 17000 предметов декоративно-прикладного искусства, обширную этнографическую коллекцию, археологические находки, региональную геральдику, а также фотографии и документальные свидетельства, рассказывающие об истории Йошкар-Олы.
В 2005 году, ко Дню Победы, открылся отдел воинской славы, включающий два зала: первый посвящен Великой Отечественной войне, второй — современным войнам, отразившимся на жизни марийцев (афганская, чеченская войны). Отдел располагается по адресу: улица Первомайская, 128 (в 1,5 км от главного здания).
За годы работы музей посетило большое количество горожан, гостей из городов России, ближнего и дальнего зарубежья. Двери музея распахнуты для всех, кому интересна история одного из древнейших городов России.
Музей разместился в доме известного царевококшайского купца-лесопромышленника Т.В. Чулкова.