Музейное дело зародилось в Елабуге в конце XIX века, первое упоминание о музее встречается в Вятских губернских ведомостях за 1898 год.
25 августа 2007 года состоялось торжественное открытие музея, которое стало возможно благодаря участию первого Президента Республики Татарстан М.Ш. Шаймиева и поддержке премьер-министра Р.Н. Минниханова. Обновленный музей разместился в великолепном особняке купца Николаева на улице Казанская, и сочетает в себе классические музейные традиции, в тоже время является необычным, современным музейным комплексом.
Большие просторные залы, доступная среда, тематическое разнообразие комплекса и современные информационные технологии нацелены на самый широкий круг посетителей.
В шести залах Музей собрал различные тематические экспозиции: археологии, этнографии, геологии, природы и истории развития края.
В большом зале «Колесо истории» последовательно представлены исторические этапы, а в центре зала портретная галерея исторических личностей, уроженцев Елабуги и знаменитостей, чьи имена связаны с историей города.
В «Купеческой гостиной» создано интерактивное фотоателье. В зале «Уездный город» размещен электронный макет Елабуги заповедной, со зданиями-памятниками и информацией о них. В открытом доступе на подиумах размещены жернова, прялки и веретена, ступки и пестики, угольные и чугунные (нагревательные) утюги, ткацкий станок и пр.
Экспозиция музея постоянно обновляется и дополняется: в 2017 году во дворе музея появились сезонные (летние)экспозиции, рассказывающие об истории почтового дела и советской эпохе.
Тематически разнообразный и необычный музейный комплекс предлагает посетителям побывать в Живом уголке. Для самых юных туристов организован «трогательный» зоопарк с возможностью прикоснуться к животным, поучаствовать в кормлении и уходе за ними, что актуально не только для детей, но открывает новые перспективы для людей с ограниченными возможностями.