Знакомство с музеем начинается с Зала природы, где представлены останки вымерших животных: мамонтов, большерогового бизона, части окаменевших деревьев, отпечатки древних растений, полезные ископаемые.
Природа края отражена в диорамах, изображающих экосистемы лиственного леса, водохранилища, поля, памятника природы «Игимский бор», самого крупного болота Татарии Кулегаш. Поймы реки Мензеля оформлены в диораме «Фенологические окна».